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农民在耕地上种树是否违法，违反农村土地承包合同，不是个人说了算，因为有专门的土地承包法律。违法占用永久基本农田发展林果业有明确的处罚标准和执法部门。农村土地发包给农民是为了解决吃饭问题，承包合同要求保护耕地不改变用途。违反合同是违法违约行为，需限期改正或治理，严重伤害耕地的应受惩罚。农民应重新学习法律，纠正不当行为。懂法明知故犯的乙方可能面临土地收回重新发包的后果。
法律分析
农民在耕地上种树，违不违法，违不违反农村土地承包合同，不是任何一个人信口张来说了算，毕竟农村土地承包，有专门的土地承包法律。
非法占用永久基本农田发展林果业处罚标准及执法部门明确
中华人民共和国土地管理法实施条例第五十一条规定违反法律依据：《土地管理法》第三十七条的规定，非法占用永久基本农田发展林果业或者挖塘养鱼的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正；逾期不改正的，按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下的罚款；破坏种植条件的，依照《土地管理法》第七十五条的规定处罚。
《土地管理法》第七十五条：违反本法规定，占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的，或者因开发土地造成土地荒漠化、盐渍化的，由县级以上人民政府自然资源主管部门、农业农村主管部门等按照职责责令限期改正或者治理，可以并处罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
农村土地发包给你，其目的是解决农民吃饭的问题
吃饭是一件大事，吃饭是人类持续生存的问题，因此，农村土地不管在一轮承包还是在二轮延包过程中，发包方都与农户签订了农村土地承包合同，合同其中都有一条:乙方在承包期间，要保护好耕地，不得随意改变耕地用途。
很明显，就是你在承包期间，不得将土地拿来种树，既然你在自己承包的土地上种树，就是你单方面改变了耕地用途。单方面改变耕地用途，就是给耕地造成永久性伤害，就是破坏国家保护18亿亩耕地红线行为，就是违法，就是违约。
农民在自己承包的土地上，发生了违法和违约行为，一般有两种情况产生，一种是不知不觉，一种是明知故犯。因为疏忽，在不知不觉中违反了《承包法》和承包合同，这样情有可原，但是，应自觉重新学习一下《承包法》，读一下承包合同书，做到早觉醒，早纠正不妥的做法。
因为懂法，明知故犯，甲方是要给乙方违法行为作出一定的惩戒（主要是针对严重造成耕地永久性伤害的那种），强制乙方限期将承包的土地进行复垦，同时，终止承包合同，收回土地重新发包。
结语
农村土地承包是根据专门的法律进行的，任何人都不能随意改变耕地用途。根据《土地管理法》和相关法规，非法占用永久基本农田发展林果业或者破坏种植条件都将受到处罚。农民在承包土地上种树属于单方面改变耕地用途，违反了合同约定，也违反了法律规定。对于违法行为，应该及时纠正并遵守法律。对于故意违法的情况，应采取相应的惩戒措施，包括限期复垦土地、终止承包合同并重新发包。了解法律、遵守合同是每位农民应该做到的，以保护耕地资源、维护农村发展的可持续性。
法律依据
中华人民共和国农业法（2012修正）：第九章 农民权益保护 第七十二条 各级人民政府、农村集体经济组织或者村民委员会在农业和农村经济结构调整、农业产业化经营和土地承包经营权流转等过程中，不得侵犯农民的土地承包经营权，不得干涉农民自主安排的生产经营项目，不得强迫农民购买指定的生产资料或者按指定的渠道销售农产品。
国家支持和保护农民在坚持家庭承包经营的基础上，自愿组织区域化、标准化种植，提高农业机械的作业水平。任何单位和个人不得以区域化、标准化种植为借口，侵犯农民的土地承包经营权。
中华人民共和国农村土地承包法（2018修正）：第二章 家庭承包 第四节 土地承包经营权的保护和互换、转让 第二十八条 承包期内，发包方不得调整承包地。
承包期内，因自然灾害严重毁损承包地等特殊情形对个别农户之间承包的耕地和草地需要适当调整的，必须经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，并报乡（镇）人民政府和县级人民政府农业农村、林业和草原等主管部门批准。承包合同中约定不得调整的，按照其约定。